胃腸超聲能夠全方位、多角度觀察胃臟內部結構，清晰顯示胃腸黏膜下腫物，診斷腫瘤性疾病（胃腸淋巴瘤、神經內分泌瘤、間質瘤、胃癌、食管癌）、非腫瘤性疾病（急慢性胃炎、胃及十二指腸潰瘍、胃息肉、胃底靜脈曲張等）、胃腸功能紊亂性疾病（胃動力減低、胃食管反流、食管裂孔疝、幽門梗阻、胃下垂）等。彌補X線和胃鏡不易顯示的胃壁來源病變，特別是對胃鏡不易診斷的胃彌漫浸潤型癌、淋巴瘤及神經內分泌瘤的早期診斷有特異性。

胃部病變需動態復查隨診者，如消化性潰瘍和胃癌新輔助化療療效觀察與評估。

胃的功能檢測，如胃的容受性、排空動力性和胃食管反流性疾病等。

胃底靜脈曲張、胃石癥。

所有健康體檢人員，其是一種較好的篩選手段，同時也適宜大規模開展胃癌的普查工作；

特殊人群：患有高血壓或者心臟病的老人、術后或治療后復查等；

無法耐受胃腸鏡、X線鋇餐檢查的患者。